1999年，由于数码世界资料异常增生，导致数码世界和现实世界的连接发生紊乱。地球上相应地出现奇怪的自然现象：东南亚没有下雨，池塘全部干涸；中东却因为连场大雨发生洪水；美国则遇到有史以来最寒冷的冬天。

【STORY】　　生活着众多从未见过的新的Pocket Monster的新的世界，踏上伊苏地区的旅行。　　熟悉的组合，小智和皮卡丘，现在的两人又了微妙的变化，新的关键词是「速度感」和「新鲜感」　　在伊苏地区旅行的小智，一个接一个遇到新的Pokemon们以及全新的口袋妖怪训练师们。以从未有过的速度展开Pokemon训练师之间的对战，新加入的伙伴们陆续登场，还有从不认输的皮卡丘带来的新的变化，Pokemon的终极进化！你从未见过的Pocket Monster新世界的冒险即将展开！【STAFF】　　总监督汤山邦彦　　监督须藤典彦　　系列构成富冈淳广　　人物设计山田俊也　　总作画监督广冈岁仁　　美术监督钱村本义　　色彩设计吉野记通　　摄影监督白井久男　　编辑边见俊夫　　音乐宫崎慎二　　音响监督三间雅文　　【CAST】　　小智：松本梨香　　爱丽丝：悠木碧　　田都：宮野真守　　武藏：林原惠　　小次郎：三木眞一郎　　喵喵：犬山犬子　　皮卡丘：大谷育江　　龙牙兽：津田美波　　小球獭：福原美里　　藤叶蛇：林原惠　　暖暖猪：水田芥末　　杂耍(暂译)：藤村知可

1999年，由于数码世界资料异常增生，导致数码世界和现实世界的连接发生紊乱。地球上相应地出现奇怪的自然现象：东南亚没有下雨，池塘全部干涸；中东却因为连场大雨发生洪水；美国则遇到有史以来最寒冷的冬天。　　11岁的少年八神太一（藤田淑子 配音），和伙伴石田大和（风间勇刀 配音）、武之内空（水谷优子 配音）、泉光子郎（天神有海 配音）、太刀川美美（前田爱 配音）、城户丈（菊池正美 配音）、高石武（小西寛子 配音）一起参加了夏令营，一次意外却被神秘地送到了一个多彩的数码世界。在那里，他们得到了叫做“数码宝贝”的搭档。进入数码世界后，八神太一一行人遇到了凶恶的怪兽贝壳兽，眼看大家都要被抓住的时候，太一的亚古兽忽然进化成为暴龙兽，拯救了他们。进化到底是怎么回事情？数码世界究竟是什么？无数的谜团出现在被召选的小朋友们面前，精彩的冒险就这样开始了……