本剧改编自手冢治虫的《新选组》，讲述了父亲被斩杀的丘十郎为了磨练剑术报仇加入了新选组。在入伍考试中认识了冷酷的少年大作。出身不明，剑手光一的大作作为期待的大型新人被引入新选组。2人虽然培养了火热的友情，但不知不觉被时代的波浪捉弄，进入了必须互相残杀的悲壮的命运。

早在八百年前，人类的欲望催生出21枚核心硬币。凡是得到硬币的人，必将获得巨大的力量。2011年6月，德国图林根州，鸿上基金会的会长鸿上光生（宇梶刚士 饰）率领探险队深入图林根州某森林的腹地，经过不断地勘测和挖掘，终于找到了核心硬币的埋藏点，却无意间解开了尘封数百年的封印，而且也使森林和东京的新宿发生对调。伴随着巨大的变动，无数中世纪士兵从山洞中走出，展开残酷的杀戮。偶然路过附近的火野映司（渡部秀 饰）与泉信吾（三浦凉介 饰）卷入混乱，与武士们展开战斗。在武士的身后，是有着强大能力的炼金师盖拉（酒井美纪 饰），她复活后发誓成为成为新世界的主宰——奥兹（OOO）。　　混乱中，所有的人都被卷入德川八代将军吉宗（松平健 饰）所在的江户时代……

从未出现过的敌人开始出现在风都，而鸣海亚树子不知为何带走了照井龙的Accel驱动器以及Accel记忆体。在左翔太郎和菲利普的帮助下，照井龙开始探寻自己的过去，而在此期间他们与早已死去的鸣海庄吉产生了交集；另一边，鸿上基金会找到日本战国时期名将织田信长的坟墓，他们开始利用这难得的机会去实现他们图谋已久的目标，而无欲无求的青年、假面骑士OOO的变身者火野映司和他们的同伴们也开始注意到自己周围发生的异变，他们将会和来自风都的假面骑士们产生什么样的交集呢？

暂无剧情

并不平静的一天，变身为假面骑士OOO的火野映司（渡部秀 饰）协同伙伴Ankh（三浦凉介 饰）与修卡战斗。谁知关键时刻，战局突然发生意外，一列时空列车DenLiner不期而至出现在二人面前。他们见到了可以变身为假面骑士电王的幸太郎（樱田通 饰），为此大为惊讶。二人趁乱登上列车，然而列车长严厉禁止他们下车，以免扰乱历史走向。列车回到了1971年，假面骑士电王与异魔神展开输死决斗，而就在此时，Ankh偷偷留出车厢寻找硬币，最后被映司等人抓了回来。当他们重返自己所处的时代，发现整个世界已经天翻地覆，修卡前所未有壮大，几乎统治了全世界。　　不肯认输的映司和Ankh与修卡展开战斗……

明治维新运动后十二年，日本迎来了新时代。曾经叱咤风云的刽子手绯村剑心如今已成为和平主义者，与朋友们一起在东京过着平静的生活。一天晚上，剑心最喜欢的餐厅遭到炮火袭击，只留下一张写着“人诛”的字条——有人准备替天行道，审判之日近在眼前。此人名为雪代缘，对剑心怀恨在心，带着一众手下前来复仇。目睹无数无辜之人被牵扯进这场残酷的斗争，剑心终将面临一场审判，并由此找到对过去的救赎。

进入了明治时代，曾经的“刽子手拔刀斋”绯村剑心（佐藤健 饰）已经习惯了神谷道场的安宁生活。谁知就在这一天，倒幕战争时的旧友——号称维新三杰之一的大久保利通（宫泽和史 饰）将其请去。原来继承了剑心刽子手身份的志志雄真实（藤原龙也 饰）当年被新政府背叛，侥幸活下来的志志雄正秘密筹措称霸日本的可怕计划。大久保死后，深感背负不可推卸责任的剑心只身上路，在途中不仅偶遇京都女忍卷町操（土屋太凤 饰），还在新月村和志志雄有了第一次的遭遇。与此同时，相乐左之助（青木崇高 饰）、神谷薫（武井咲 饰）、明神弥彦（大八木凯斗 饰）、斋藤一（江口洋介 饰）也相继赶往京都。阴云密布的时代，酝酿着一场席卷全国的风暴……　　本片根据和月伸宏的经典漫画原作改编。